茶尺蠖小rna病毒5’端非編碼區的克隆和測序及與哺乳動物小rna病毒的比較分析
發布時間:2025-11-10 點擊:2
用trizol從純化的茶尺蠖ectropis oblique小rna病毒(eopv)中提取病毒基因組rna,逆轉錄后加poly(dt),然后進行兩步pcr擴增基因組5’端。克隆測序后,對其5’端非編碼區的核苷酸序列進行分析,發現具有哺乳動物小rna病毒的5’端非編碼區的一些特征:a/t含量豐富、起始密碼子上游aug和小順反子多。利用mfold預測了eopv5’端非編碼區的二級結構,存在4個莖環結構,有哺乳動物內部核糖體進入位點(ires)的保守區域,即含保守基序gnra的莖環a和a/c豐富的環b及多聚嘧啶區域。據此推測eopv基因組翻譯采用ires起始機制。完成機構:武漢大學生命科學學院,武漢430072