茶樹是由根、莖、葉、芽、花、果等不同器官的構成的整體，在生長發育過程中，各個器官具有不同的形態和不同的生理機能，有了有效地栽培茶樹，必須了解各個器官的機能及其與栽培環境條件的關系。在生產上通常把茶樹分作地上和地下兩大部分，地下部為根系，地上部為樹冠，包括枝、葉、芽、花、果等部分。根頸是地上和地下兩種功能不同器官的交界處，它是茶樹各器官中比較活躍的部分。
1、根
根埋在土中不易引人注意，其實它的分布與生長動態，是制訂茶園管理措施的主要依據之一。從某種意義上講，所謂栽培，首先要培養好根系。俗語：根深葉茂，本固枝榮，正是這個重要性的說明。
茶樹的根系由主根、側根和須根構成。由種子的胚根垂直向下生長的根，稱為主根，可伸入地下2-3米，甚至更深，但一般為1米左右。在主根上著生的統稱為側根。由主根上直接發生的側根，稱一級根，著生在一級根上的是各級分枝的側根，側根分布面很廣，壯年時期側根分布深達60-80厘米。在條栽茶園中滿布行間，交叉伸展。主根和側根粗長呈紅棕色，壽命長，起固定、輸導、貯藏等作用。主根和側根上著生的細小根，統稱須根。須根細短呈白色，一般壽命較短，不斷死亡更新，未死亡的則逐漸發育成側根。須根大部分布在土壤的耕作層，深在5-45厘米之間，具有吸收能力和明顯的趨肥生。45厘米以下的須根很少。根除了主根、側根外，還有一類根可以莖、葉、老根上生出，這種根叫不定根（相對地把主根和側根叫定根），如用扦插、壓條等無性繁殖的茶樹所形成的根。
營養繁殖的茶樹，是由入土部分基部具有分生能力的細胞分化成根體，由此而產生根群，其中有1-2根向深處發展而行主根的作用。
主根和側根分布的深度和范圍，因品種、樹齡、生態條件及農業技術措施而有明顯差異。大葉種的茶樹主根明顯，根系分布也較中、小葉種深廣。根系的生育隨年齡而增長，幼苗期主根較發達，隨后不斷分化，不斷分生側根。當主根受到阻礙或抑制時，部分側根就能迅速生長，向土層深處伸展，代替主根的作用。在有機質多的酸性土中，根系發育良好。在缺乏有機質的粘土，或排水不良，土層淺薄，根系生育就差。通過深耕施基肥的，根系能向土層深處擴展，否則多集中土壤表層，因此，茶園土壤管理必須以根系生育規律為主要依據。
茶樹根系的生長發育在一年中是有節奏的，與地上部的生長發育交替進行。其營養物質的積累和消耗，常隨季節而有變化，如茶季新梢生長旺盛時，地上部需要大量營養物質，此時根系營養物質的消耗便大于積累；茶季結束后，進行根系營養物質的積累階段。由此可見，加強秋冬季茶園管理，可促進根系生長和營養物質的積累，提高樹體營養水平，增強越冬能力，有利于早春茶樹的萌芽以及新梢的生長。
根在茶樹生育雖起著特別重大的作用。茶樹體內所需要的物質，除部分由葉從空氣中吸取外，大部分都是由根從土壤中吸收的。根還有合成的能力，能制造某些重要的有機物質，這與整個茶樹的新陳代謝，特別是與合成蛋白質所必須的氨基酸的合成有關。例如，茶氨酸是茶樹體內所特有的，它在許多特性中起著特殊的和重要的作用。根據研究，茶氨酸的前期化合物是在葉片內形成的，并從葉片轉移到根部，在根部完成生物合成，而后再從根部轉移到正在生長的新梢頂端。同時，茶樹根部貯藏的物質對更新復壯后枝葉的旺盛生長起著決定的作用。此外，根系深入土中，還具有固著和支持樹體的功用，并兼有繁殖的和更新復壯的機能。
2、莖
茶樹的莖是由營養芽發育而成的。幼莖十分柔軟，著生茸毛，表皮呈青綠色，隨著新梢增長逐漸木質化，表皮色澤由青綠色而變淡黃，再由淡黃而轉淺棕，以后色澤變深，皮孔漸大，形成裂紋。二三年后枝條表皮色澤變成淺灰，老枝條色轉暗灰。
茶樹的分枝習性一般表現為兩種形式，即單軸分枝與合軸分村。自然生長的茶樹一般在二、三齡媽內為單軸分枝，這種分枝的特點是頂芽不斷向上生長，形成明顯的主干，分枝較短，樹體向高處生長。到四齡以后轉為合軸分枝，這種分枝的特點是主干的頂芽到一定高度便死亡或生長很慢，近頂端的側芽代替了頂芽的生長，表成側枝，不久側枝的項芽也停止生長，繼續由下面的側芽代替，結果使樹冠呈現開張狀態。掌握茶樹的分枝規律，就可采取修剪，打頭，分批采摘等方法，有助于大量側芽的生長，擴大樹冠面和芽密度。
按分枝習性不同，通常將茶樹分為喬木型、小喬木型和灌木型三種。喬木型茶樹，植株高大，具有明顯直立的主干；小喬木型茶樹，植株中等高度，分枝部位離地面較近，主干仍屬明顯；灌木型茶樹，分枝靠近地面或或從根頸處發出，無明顯的主干